生物工程（国家级特色专业、广东省名牌专业）本专业具有扎实的学科基础、雄厚的师资力量和良好的实验条件，拥有多个条件优越的学生科技创新与教学实践基地，以及发酵工程及生物化工硕博士点，为学生学习与深造提供了极大的空间。
本专业含生物工程和生物制药两个方向。
（1）生物工程方向本方向主要培养具有以下知识和技能的专业人才：(1)掌握微生物菌种选育、现代生化技术、生物工程工艺原理、生物工程与设备、生物反应优化控制等基本知识和技能；(2)掌握基因工程、酶工程、细胞工程、发酵工程、生化工程、组织细胞培养、环境生物治理等现代生物高新技术的基本理论和技能。
（2）生物制药方向本方向主要培养具有以下知识和技能的人才：(1)掌握基因工程、酶工程、细胞工程、发酵工程和生化工程等现代生物高新技术的基本理论和实验技能；(2)掌握生物工程相关药物的开发、生产原理、生产工艺、分离纯化技术、质量监控和工程设计等；(3)具有生物药物新资源、新产品、新技术研究开发的初步能力。
毕业去向：生物工程公司、生物制药公司、保健食品公司、环保公司、生物工程相关研究机构以及卫生防疫、商检、外贸等部门。
主要从事技术管理、工艺设计、工程设计、新产品开发、新技术研究、生物检验、技术监控等工作。
毕业生也可在国内外继续攻读硕士、博士学位。