交通运输专业是1958年我校初建时由铁道运输专业创始人之一、著名留美学者林达美教授带领北京交通大学运输系部分教授和骨干教师成建制迁兰组建而成。
现为国家级特色专业。
该专业依托交通运输规划与管理硕士点、交通运输工程一级学科博士点、交通运输工程博士后流动以及交通运输规划与管理甘肃省级重点学科。
该专业以优异成绩通过了教育部工程教育专业认证，现拥有两门国家级精品课程，曾获国家级教学成果二等奖和省级教学成果奖20余项，获包括国家科技进步一等奖在内的30余项国家级、省部级科研奖励。
目前承担包括国家自然科学基金、教育部博士点基金在内的多项纵横向项目。
现有教师30余人，其中教授9人（博导3人），副教授12人。
具有博士硕士学位的教师占95%。
主干课程：管理运筹学、铁路运输设备、铁路信号与控制、铁路货物运输组织、铁路行车组织基础、铁路运输调度与统计分析、站场与枢纽设计、运输经济学、高速铁路技术、客运专线运输组织、交通运输系统分析、运输市场营销、多式集装联运等。
该专业培养具有宽广的基础理论和扎实的专业知识，能在国家及省、市的交通运输管理部门、铁路和大型厂矿企业从事运输规划、场站设计、调度决策和运输组织的高级技术人才。