专业前景生物工程专业是以基因工程、蛋白质工程、细胞工程、发酵工程为基础，以生物分离工程为重点，以发酵、酿造为核心，为生物技术的工业化和工程化培养掌握现代生物技术的高级专门人才。
专业特色产学研合作，校企双赢：本专业先后与绿洲啤酒麦芽集团、莫高葡萄酒业有限公司、黄河啤酒有限公司、兰州庄园乳业公司等多家单位签订了“产学研”战略合作框架协议，形成了特色鲜明的合作办学模式。
不仅为企业提供应用研究和技术开发服务，也为学校科研成果转化，学生教学实习、就业等方面提供便利条件。
同时，在教学中强调实践教学，注意培养学生的实践技能和动手能力，通过课堂模拟、案例分析、参观、教学实习、毕业实习及专家讲座等方式，不但加强了专业知识，而且提高了学生实践能力，从而达到较好的教学效果。
培养目标培养适应社会主义现代化建设的需要，德、智、体、美全面发展，具备坚实的自然科学和人文社会科学基础，具备外语和计算机应用能力，掌握生物技术及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论、基本技能，能在生物技术与工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的工程技术人才。
培养要求本专业学生主要学习微生物学、生物化学、化学工程、发酵工程等方面的基本理论和基本知识，受到生物细胞培养与选育、生物技术与工程等方面的基本训练，具备较好的思想道德素质、文化素质、专业素质和身心素质，具有获取知识、应用知识和创新的能力。
具备在生物技术与工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的基本能力。
主干课程高等数学、有机化学、基础生物化学、微生物学、化工原理、生物工艺学、生物工程设备、酶工程、发酵工程、生物分离工程、代谢控制发酵、葡萄酒工艺学、氨基酸工艺学就业方向毕业生可到生物制药、发酵工程等领域的企业从事技术开发和生产管理工作，也可到有关高等院校、科研单位从事教学、研究工作。
继续深造学生毕业后可在食品科学、发酵工程、食品生物技术等方向继续深造。