制药工程专业该专业培养从事药品制造，新品种、新工艺、新设备开发和设计的高级工程技术人才。
本专业学生应掌握化学、药学、工程学等方面的基本理论、基础知识和实践技能，具有对药品新资源、新产品、新工艺进行研究和设计的能力，毕业后能够从事药品生产与质量控制、工艺设计与革新、新药研究与开发以及生产经营与管理等工作。
专业主干课程：有机化学、化工原理、药物合成反应、药物化学、药理学、药剂学、天然药物化学、药物分析、制药工艺学，制药设备与工程设计等。
该专业课程体系基本覆盖了国家执业药师考试科目，毕业生择业面广，可在科研院所、制药企业、药品监督管理部门、医药公司等企事业单位从事研究、开发、生产、管理、经营等工作。
该专业有权授予硕士和博士学位。